Скорее, они возникнут с Windows...
А если серьезно, то неужели бывает FrontPage на Linux? Вообще могу предположить, что Windows будет чуть удобнее. Все-таки, родная среда. И еще вот почему: из-за названий файлов. Если Вы работаете под W и не соблюдаете правил оформления имен файлов и каталогов для совместимости с L, то будут проблемы с L.