Если в договоре или прайсе не написано, что вы должны делать что-то (например, эти настройки), то вы их и не должны делать. И все "требования" клиента по этому поводу - не более чем шум орехов. Вы можете пойти навстречу его ПРОСЬБАМ, если считаете возможным, а можете и не пойти. Не обязаны.
То же самое и с настройками для скриптов. Клиент не может требовать того, чего не записано в условиях договора. Если у него позиция формальная ("в договоре записаны лимиты, я их не превышаю - включайте"
, то и у вас может быть позиция формальная, причем гораздо более обоснованная: "в договоре не записаны лимиты на скрипты - ничего включать/увеличивать не будем".
В такой ситуации лучше всего расторгнуть договор и вернуть деньги, если был заплачен аванс.